Дозу фосфоритной муки устанавливают также в зависимости от кислотности почвы. На сильно- и среднекислых почвах (pH 5 и менее) можно вносить ту же дозу фосфоритной муки, что и суперфосфата, а на слабокислых — двойную и даже тройную. На произвесткованных почвах эффективность ее снижается. Фосфоритную муку применяют как основное удобрение, вносить ее лучше заблаговременно, с осени, обязательно с глубокой заделкой под плуг. Наиболее эффективно внесение ее вместе с навозом в пару под озимые культуры, а также под пропашные — сахарную свеклу, картофель, кукурузу и др. Положительное действие фосфоритной муки продолжается несколько лет. Чем больше доза этого удобрения, тем эффективнее и продолжительнее его действие. Для увеличения содержания подвижного фосфора в кислых почвах применяют фосфотирование — внесение высоких доз фосфоритной муки. При этом одновременно достигают некоторого снижения кислотности почвы. Фосфотирование кислых почв — один из основных технологических элементов работ по комплексному агрохимическому окультуриванию полей (КАХОП).