Важным моментом при раскрытии применения принципа свободы договора является использование аналогии в гражданско-правовых отношениях. В гражданском праве пробелом считается ситуация, когда то или иное отношение не урегулировано нормативными актами или соглашением сторон и отсутствует применимый к ним обычай делового оборота (статья 6 ГК РФ). Но во всех случаях права и обязанности сторон должны быть определены, а в случае возникновения спора он должен быть решен судом. В противном случае реализация принципа свободы договора может привести невозможности реализации принципов обеспечения восстановления нарушенных прав и их судебной защиты. Для недопущения подобного в праве разработаны институты аналогии права и аналогии закона.