Когда была утверждена Конституция федерального значения, он адресовал свое обращение к Дж. Мэдисону, в котором аргументировал потребность дополнения Конституции правами свобод, цитируя ранее разработанный им же «Билль о правах» где касательно данной проблемы уже содержится четкий правовой триумвират Локка (5-я поправка). Он порицает позиции Дж. Локка и Т. Гоббса, которые подчеркивают, что, становясь социальным элементом, личность автоматически теряет все естественные права. Право собственности базируется на естественных необходимостях личности, посредством того, что всякое обеспечение должно быть направлено на их ублажение. Имеется категория прав, в особенности пренебрегаемые государственной властью. Сюда причисляется свобода мысли и их выражение в устной либо письменной формах, неограниченной коммерции, а также личная неограниченность и сокровенность. Особенно оригинальна его формулировка права на свободный обмен мнениями и информацией: «Право свободной переписки и обмена мнениями, взглядами и информацией между гражданами на основе их общих интересов, как общественных, так и личных, независимо от юрисдикции, под которую эти их общие интересы подпадают... это естественное право и отнюдь не дар какого-либо местного закона». Джефферсон остается рыцарем естественных прав до конца дней своих. «Нет ничего, что нельзя было бы изменить, кроме врожденных и. неотъемлемых прав человека». Республиканские принципы организации и деятельности государства, по его мнению, должны пронизывать последовательно все уровни — организацию и деятельность федерации (по вопросам внешней и общефедеральной политики), штата (по отношению к гражданам), а также округа, района и отдельного прихода (по всем мелким, но в то же время важным местным вопросам).