Как было упомянуто выше, одним из современных вызовов является изменение окружающей среды, которое может приводить к появлению новых патогенов. Как правило, полный цикл разработки вакцины занимает 10-15 лет, причем большую часть этого времени требует не создание самой технологии, а создание и сертификация производства, клинические испытания и т.д. Тогда как, при возникновении новых инфекций требуется начать производство вакцины в течение 6 месяцев. Прогресс в области разработки синтетических вакцин позволит создать так называемые вакцинные платформы по производству трансгенных вирусов, где безопасность будет обеспечиваться основой (backbone) вируса (вирусного вектора, плазмидной конструкции), а необходимый антиген будет экстренно вставляться в основу при возникновении необходимости. Такая схема уже реализована при изготовлении сезонных вакцин от гриппа, где сертифицируется не конкретный вакцинный вирус, а технологическая цепь, позволяющая оперативно менять антигенные свойства вакцины. В ближайшем будущем ожидается разработка подобных вакцинных платформ для борьбы с потенциальными возникающими инфекциями и противодействия биотерроризму.