Институт полномочных представителей Президента в семи федеральных округах был преобразован из института полпредов Президента в регионах Указом Президента России от 13 мая 2000 г. N 849 в целях "обеспечения реализации Президентом Российской Федерации своих конституционных полномочий, повышения эффективности деятельности федеральных органов государственной власти и совершенствования системы контроля за исполнением решений". Данным Указом было утверждено Положение о полномочном представителе Президента Российской Федерации в федеральном округе, а также Перечень федеральных округов (образованы Центральный, Северо-Западный, Южный, Приволжский, Уральский, Сибирский и Дальневосточный федеральные округа). В 1990-е годы, когда власти некоторых субъектов Федерации игнорировали требования и законные интересы Российской Федерации, вынужденной мерой восстановления в регионах властных функций федерального центра стало создание института полномочных представителей Президента в федеральных округах